通过注册集体商标或者证明商标保护。

目前，约有100多个国家和地区通过注册证明商标或集体商标的方式保护地理标志。要求地理标志的持有人将该商标予以注册的生产低于范围、技术标准、商标图案等进行界定，这种界定是说明书的组成部分，当申请被批准时，该说明书就成为注册中的重要部分，对注册人和商标使用人具有法律约束力。这种保护方式的优点在于将地理标志纳入到《商标法》的保护体系内，易于对农产品的地理标志进行程序化保护，也方便在其他国家和地区取得保护。

通过《反不正当竞争法》进行保护。

用《反不正当竞争法》作为保护地理标志的这种方法，在历史上不断发展。《巴黎公约》最初规定的行为，即能够禁止或限于与虚假商号一起使用虚假产地标记的行为；后来发展为禁止使用虚假或者欺骗性的产地标记（巴黎会约、里斯本协定、马德里协定），再发展到使用地理标志构成巴黎公约第10条之二所规定的不正当竞争行为的一般性禁止。建立在反不正当竞争基础上的地理标志保护制度的主要特征之一，在于法官要在诉讼过程中明确界定该地理标志定义中的关键要素，诸如生产地域、源自地理标志指示地域的特定质量，以及地理标志的声誉。

即使在采取注册集体商标和证明商标或者专门立法保护地理标志的国家，反不正当竞争法仍然是保护地理标志的一种补充手段，例如，中国商标法就是从反不正当竞争的目的出发，规定对于含有虚假地理名称标志的商标不予注册。

专门法保护。

世界上大多数国家不接受专门法保护这种方法，目前国际范围内约有20个国家按此模式保护地理标志。这种保护方式又可细分为注册地理标志保护和原产地名称保护。法国是实施原产地保护最早的国家，它有一套完整又专门的保护方法。法国政府设立了原产地名称局（INAO），其主要职能就是对使用“经检测”的原产地名称的产品的质量进行检测和控制。对于除葡萄酒、烈性酒和奶酪以外的其他产品的原产地名称，则可以通过司法途径或者行政程序认定。

除上述保护模式外，有的国家采用对不同产品的地理标志适用不同的法律和程序给予保护的做法。如澳大利亚制定了专门的法律《澳大利亚葡萄酒和白兰地联合体法案1980》，葡萄酒地理标志的保护要依据该法进行注册保护，除葡萄酒之外的产品标志则依据《商标法案1995》通过注册证明商标保护。

中国目前存在三套地理标志保护制度，即：

根据《中华人民共和国农业法》、《中华人民共和国农产品质量安全法》、《农产品地理标志管理办法》由中华人民共和国农业部批准登记的农产品地理标志；

根据《中华人民共和国商标法》、《中华人民共和国商标法实施条例》、《集体商标、证明商标注册和管理办法》由国家工商行政管理总局批准作为集体商标、证明商标注册的地理标志；

根据《中华人民共和国产品质量法》、《中华人民共和国标准化法》、《中华人民共和国进出口商品检验法》、《地理标志产品保护规定》由国家质量监督检验检疫总局批准实施保护的地理标志产品。